正如前面提到的，犬和猫螺杆菌性胃炎诊断存在一个问题，即大多数临床正常的动物胃内都发现了这种细菌。

然而如果没有得出其他诊断结果，即没有异物、浆细胞-淋巴细胞性胃炎、肠炎或幽门阻塞的话，还是应该对具有胃病临床症状的感染动物进行治疗。现在的治疗方法是使用奥美拉唑(0.7～1.0mg/kg，每天1次)、甲硝唑(20mg/kg，每天2次)和阿莫西林(20mg/kg，每天2次)。以上三种药物都通过口服给药，服用2周以上。