真菌性疾病大致可分为两类，一类是由病原性真菌感染引起的疾病，称为真菌病; 另一类是由产毒性真菌所产的毒素被食入后所导致的疾病，称为真菌中毒症。然而，如烟曲霉菌和黄曲霉菌等致病性真菌，则兼有感染性和产毒性。本节主要介绍由病原性真菌感染的真菌病，即犬、猫的真菌病。

犬、猫的真菌病包括皮肤真菌病、浅在真菌病和深部真菌病三类。主要的皮肤真菌病有：感染皮肤的犬、猫孢子菌病，犬、猫毛癣菌病; 浅在真菌病有： 感染皮下或黏膜的犬、猫颗粒性皮炎、犬鼻孢子菌病; 深部真菌病有： 感染淋巴结的犬、猫丝状菌病，感染犬角膜的犬曲霉菌病，感染犬、猫皮肤、消化道和中枢神经的隐球菌病，感染犬、猫皮肤、肺、胃的犬、猫芽生菌病，感染犬、猫肺、脾和淋巴结的犬、猫组织胞浆菌病，感染犬、猫支气管、淋巴结、肺、脾、肾、胃的犬、猫球孢子菌病。

真菌的抵抗力很强，在干燥环境中可生存3～4年，煮沸1小时才能杀死，2%～5%氢氧化钠溶液、3%甲醛液可用于消毒，一般消毒药不能杀死。