以不同种微生物的菌(毒)种制备的疫苗为异源疫苗。接种动物后能使机体获得对疫苗中不含有的病原体产生抵抗力，如犬接种麻疹疫苗后能产生对犬瘟热的抵抗力; 兔注射纤维瘤病毒疫苗后能抵抗粘液瘤病。用同一种中一个型(生物型或动物源)微生物种毒制备的疫苗也是异源疫苗。接种动物后能使其获得对异型病原体的抵抗力，如接种猪型布氏杆菌弱毒疫苗后能使牛获得对牛型、羊获得对羊型和绵羊获得对绵羊型布氏杆菌病的免疫力。