称变量分析，它是应用数学方法将试验数据的总变异剖分为不同来源的变异，从而判明试验中各因素作用大小的一种统计方法，它广泛应用于猪试验资料的统计分析中。分析的基本步骤有：①提出数据资料的数学模型;②根据数学模型，将数据总变异的平方和及自由度剖分为不同变异来源的平方和及自由度;③计算出各项均方，用合适的均方构成检验统计量F，进行F检验;④若F检验显著或极显著，对固定效应进行多重比较，以明确各处理均数间的差异显著性，多重比较常用的方法有最小显著差数法(LSD法)和最小显著极差法(LSR法)，LSR法又包括q检验法和新复极差法两种。⑤必要时，对随机效应估计出方差组分，方差组分广泛应用于猪数量性状遗传参数(如遗传力、重复力、遗传相关)的估计中。最常用的方差分析中，平方和及自由度的剖分式为：①单因素方差分析：SST＝SSA+SSe，dfT＝dfA+dfe;②交叉分组两因素无重复观察值的方差分析：SST＝SSA+SSB+SSe，dfT＝dfA+dfB+dfe;③交叉分组两因素有重复观察值的方差分析：SST＝SSA+SSB+SSAXB+SSe，dfT＝dfA+dfB+dfAXB+dfe;④系统分组两因素资料的方差分析：SST＝SSA+SSB+SSe，dfT＝dfA+dfB+dfe。