全部杀灭物体内外和部分杀灭动物体表、外界环境中微生物的手段。灭菌可消除全部微生物;消毒只要求达到无传染性， 对非病原性微生物及细菌芽胞不要求全部杀死。灭菌和消毒的方法有物理学、化学和生物学三类。

物理学法 包括热力、干燥、日光、电离辐射、声波及滤过除菌等方法。

热力 高温可使蛋白质凝固变性、破坏细胞结构，故对微生物有明显的致死作用，是最可靠的灭菌手段。包括： 煮、蒸、烧、烤， 前二者称湿热灭菌， 后二者称干热灭菌。灭菌效果的好坏， 除取决于热力的强度和作用时间外， 还与周围环境的含水量有关， 含水量高时热的穿透力强， 蛋白质凝固变性快， 所以湿热灭菌效果比干热灭菌好。

湿热灭菌法有多种。①煮沸法：利用消毒器将水煮沸约100℃，经5～10分钟，细菌繁殖体即被杀死，但细菌芽胞则需1～2小时;用于刀、剪、注射器等的消毒。②流通蒸气法：常用阿诺氏流通蒸气灭菌器，温度一般不超过100℃，蒸15～30分钟，常见微生物均可杀死，用于外科器械等的消毒。③间歇灭菌法：在阿诺氏灭菌器内，以流通蒸气蒸15～30分钟，随后将灭菌物移到37℃恒温中过夜，使芽胞发育成繁殖体，翌日再蒸，每天一次，连续3天，芽胞尽被杀死，用于不耐高温的糖培养基、牛奶培养基等的灭菌。④巴氏消毒法：加热61.1～62.8℃30分钟或71.1℃15～30秒，杀灭不耐热液体物质中的病原微生物或特定微生物，用于牛奶及酒类的消毒。⑤高压蒸气灭菌法：加热密封的高压蒸气锅，使水蒸气的压力达到102千帕，温度达121.3℃，维持15～20分钟，可破坏包括细菌芽胞在内的一切微生物，是一种最有效的灭菌方法，用于普通培养基、含菌污物及动物尸体等的灭菌。

干热灭菌法有两种。①焚烧法：在火焰上烧灼或燃烧;用于接种环、被微生物污染的纸张、耐焚烧的器皿及动物的传染病病尸等的灭菌。②干热空气法：将干烤箱中的空气加热至160～180℃并维持1～2小时，包括细菌芽胞在内的一切微生物均可杀死，用于玻璃器皿、瓷器或注射器等的灭菌。

干燥 水是一切生命活动的基础，因而干燥可以抑制细菌生命活动、缩短细菌的存活时间，达到灭菌的目的，但干燥对细菌的作用受多种因素影响，所以不能作为有效的灭菌手段，只能用于保存食物及防止饲料霉败。浓盐水或糖溶液浸渍对菌体有脱水作用，致使细菌原生质收缩，引起生理性干燥，具有抑制细菌生命活动的作用。

日光及电离辐射 日光中的紫外线具天然杀菌作用，主要作用于微生物DNA，破坏其分子构型，引起蛋白质及酶合成障碍，导致微生物变异以至死亡。波长2530～2650A的紫外线杀菌效力最强。商品紫外线杀菌灯的波长为2537A，供实验室、无菌室、手术室等的空气及物体表面消毒。此外， 日光中的红外线也起辅助性杀菌作用。电离辐射包括高速电子、X线及α、β、γ线等，剂量足够时，由于微生物的DNA遭破坏，发挥杀菌效力;用于羊肠线、丝线、手术刀、注射器、不耐热的塑料制品及橡胶手套等的消毒。

过滤除菌 滤器上的微孔，能机械地阻止液体中或空气中的微生物通过，达到除菌消毒的目的。常用的除菌滤器有5种：①蔡氏滤器(Seitz)以石棉板作过滤装置，滤孔分三级，K最大，EK较小，EK-S最小，除菌操作时常用EK;②硅藻土加压制的柏克菲(Berkefeld)滤器;③陶土制向伯兰(Chamberland)滤器;④嵌有细玻璃砂滤板的玻璃滤器;⑤醋酸纤维膜制的薄膜滤器。该法用于不耐热的血清、毒素、酶、抗生素、药泥及空气等的消毒除菌。但比细菌小的支原体和病毒等仍可通过，故仅有除菌作用。

声波 由超声波发生器产生的可闻声波和超声波(9000～100000赫)，可裂解大多数细菌;频率愈高，效应愈强。在声波的杀菌作用中，振幅较频率更为重要，即低频高强度声波比高频低强度声波效能高。超声波能杀死多数细菌及某些病毒。

化学法 许多化学药剂都能抑制微生物的生长繁殖，甚至将其杀死。用作防腐消毒的化学药剂种类很多，作用机理各不相同，理想的消毒剂应当是杀伤力强，无腐蚀性，能长期保存，对人和动物无毒性或毒性较小。根据消毒剂的性质可分为10类。①重金属盐类：使蛋白质凝固变性，与酶的SH基结合、破坏酶活性，亦可破坏氨基，如升汞、红汞、硫柳汞、硝酸银等。②氧化剂：破坏酶活性，破坏菌体蛋白，如漂白粉、氯气、碘酊、过氧化氢、高锰酸钾、过氧乙酸等。③醇类：使菌体蛋白变性，除去细胞膜的脂类物质，如乙醇、异丙醇等。④酚类：破坏细胞膜使菌体蛋白变性，如石炭酸、来苏儿等。⑤表面活性剂：改变细胞壁透性，如新洁尔灭、消毒净、杜米芬、洗必太等。⑥烷基化合物：对蛋白质具烷化作用而使酶失去活性，如环氧乙烷等。⑦醛类：因与蛋白质氨基结合而使细菌灭活，如甲醛、戊二醛等。⑧酸类：具有抑菌性和杀菌性，如甲酸、乙酸、乳酸、苯甲酸等。⑨碱类：因溶解细胞壁、细胞膜而致死细菌，如生石灰、烧碱等。⑩染料：如龙胆紫等。消毒剂的杀菌作用缺乏选择性，影响消毒效果的因素又很多，故可根据消毒对象和具体条件选用。

生物学法 某些微生物在生命活动过程中能产生具有抑菌或杀菌作用的细菌素及抗生素等物质;嗜热微生物产生的生物热温度可达60～70℃，高的还可达85℃，对其他不耐高温的病原微生物有杀伤作用。