中兽医是祖国医学中的一个组成部分，二者同源异流，一脉相承。据《周礼·天官》的记载，它不但把“医官”和“巫”明确地分开，而且在“医官”中更有“医师”、“疾医”、“食医”、“疡医”及“兽医”的区别。“兽医疗兽病兽疡。兽有病灌而劀(音瓜，刮去之意)之”。据此则知，我国劳动人民在周代就用方药给家畜治病了，但该书中并没有记载方剂。在现存的中医文献中，记载方剂最早的要算两千多年前成书的《内经》。《内经》中共载有12个方剂，虽然为数不多，且带有原始单方的形式，但它已有煎剂、丸剂、散剂、酒剂等制剂类型。更可贵的是，《内经》中已经创立了方剂的组织原则——君、臣、佐、使，这便为方剂的形成和发展开辟了道路。《史记·扁鹊列传》中有“越人之为方也”及“以八减之齐”、“和者煮之”的记载。这就说明继《内经》之后，多味药物相互配伍的使用方法逐渐广泛。

在现存史料中，最早记载兽医药方的是汉简(“流沙附简”和“居延汉简”等)。如“流沙附简”中有一记载：“治马伤水方：姜、桂、细辛、皂荚、附子各三分，远志五分，桂枝五钱……”从汉简中的兽医方看，当时已应用了汤剂、膏剂和丸剂;并在服药方法上有饲喂后服的区别。

东晋·葛洪所撰《肘后备急方》的卷八，即“治牛、马六畜水谷疫疠诸病方”，是现存古籍中最早的有关兽医方剂的篇章。

公元6世纪，后魏·贾思勰撰写了一部现存最古老而完整的农书《齐民要术》。其中卷六为畜牧兽医专卷，列举了治牛、马、驴、羊、猪的药方40余个，并分别采用了散、膏、煎、胶、酒、熏烟等不同剂型和用法。

现存最早的兽医药方专书为唐宋时期的《蕃牧纂验方》和《安骥药方》。《蕃牧纂验方》为宋·王愈所撰，载有57个验方，除四时调理方外，分心、肝、脾、肺、肾、杂治六部。《安骥药方》据推测为公元9世纪的著作，书中收载药方144个，并按功效和主治分为25类。这两部著作均收载于唐代著名兽医典籍《司牧安骥集》中。由于这一时期已经形成了中兽医方剂的基本理论和系列成方，因而奠定了中兽医方剂学的基础。

元代卞宝的《痊骥通玄论》中，有关于药方的专篇“痊骥通玄注解汤头”，收载方剂113个，吸收了当时中医方剂学的一些理法和酝酿规律，丰富和发展了中兽医方剂的内容。

1608年，明·喻本元、喻本亨兄弟合撰的不朽名著《元亨疗马集》付梓。该书收载了400多个兽医药方，并有“经验良方”和“使用歌方”两个方剂专篇。“经验良方”分14类，收载方剂170余个;“使用歌方”将36个常用方剂编成汤头歌，便于记忆和使用，为后世兽医广为传诵，称为“三十六汤头”。此外，《元亨疗马集》还载有关于方剂组成、配伍禁忌等方面的内容。从该书可以看出，到了明代，中兽医方剂的理论和运用已经形成了比较完整的体系。此外，明代还有杨时乔等编著的《马书》(刊行于1594年)，内容也很丰富，特别是16种蹄病的药方，很有参考价值。徐光启的《农政全书》(1639年)中，也收载了治马、驴、牛、羊、猪、狗、猫、鸡的药方1 000余个。在这一时期，朝鲜还刊行了一部《新编集成马医方牛医方》，载有马医方161个、牛医方51个，共计212个药方。这些都丰富了中兽医方剂的内容。

在清代，不少中兽医古籍都不同程度地载有兽医方剂的内容，各有特色。周维善编著的《疗马集》(1788年)，载有药方110个，称为“疗马百一方”，据认为，其中有些还是家传验方。傅述风著的《养耕集》(1800年)载有药方100多个。还有《抱犊集》、《牛经备要医方》、《牛经切要》、《相牛心镜要览》、《牛医金鉴》等，其中有不少关于医牛病的药方。《驹病集》是现存唯一的幼畜科古籍，其中的许多药方自然具有幼畜科的特点。《猪经大全》中则有50种猪病的防治药方63个，是现在所能见到的唯一猪病古代专著。流传于西南的《活兽慈舟》(约刊行于1873年)内容较全，载有黄牛、水牛、马、猪、羊、犬、猫的240种病证的药方700多个。

中华人民共和国成立以后，随着中兽医学的迅速发展，中兽医方剂的整理、应用和研究也取得了长足进步。1956年召开了全国民间兽医座谈会，来自全国的知名中兽医在会上交流了验方500多个，会后编印了《中兽医验方汇编》一书。此后，在整理有关古籍、搜集民间兽医验方、扩大方剂应用范围、探讨方剂作用机理等方面，取得了很好成效。治疗动物脾胃病证的基本方平胃散，从机理和运用两方面进行了较充分的研究和探讨。关于方剂中药味之间的配伍禁忌问题，也取得了一批研究数据，加深了“十八反”等的认识。外用的生肌散和点眼的拨云散等，实践证明疗效确实，得到了广泛应用。还创制了许多有效的验方新方剂，如知柏汤、胃肠活、跛行镇痛散、盐粟散等。祛风镇痉汤保留灌肠，用于治疗马属动物破伤风，既克服了经口灌药的困难，又提高了疗效。新的中药制剂如注射剂、冲剂、膜剂等也已在兽医上应用。中药作为饲料添加剂或预混剂的试验与探索，正在广泛开展。兽医中药成方制剂的生产从无到有，品种和数量不断增加，质量标准和检测手段也日臻完善。1976年以后，为了系统总结中兽医方剂学的理论与实践，较完整的现代中兽医方剂学著作相继问世，如李呈敏的《中兽医方剂》、张克家的《中兽医方剂学》等。在高等农业院校中也开设了中兽医方剂学课程。至此，中兽医方剂学就形成了一个较成熟的分支学科。为了使中兽医的成方制剂规范化，农林部于1978年颁布了《兽药规范·二部》，其中规定的成方制剂品种有114个;在此基础上，又制定和颁布了《中华人民共和国兽药典》二部(1990年版)，收载成方制剂81个，兽医中药成方制剂的生产和应用开始有规可循。

当前，发挥中兽医方药的优势和适应畜牧兽医事业的发展，为人们提供优质安全食品，与现代药学结合防治人畜共患疾病(如禽流感的防治等)，是中兽医方剂学发展的基本趋势。一方面，用中药方剂防治动物疫病和促进其生产性能，具有强调辨证、注重整体、毒副作用小、在食用动物产品中很少残留等优势，为人们生产安全畜产品，应进一步发挥作用;与此同时，也要吸收现代药学的长处，采用生理学、药理学、药物化学及生物工程的方法，研究中兽医方剂的作用机理，提高疗效，改革剂型，使中兽医方剂学的理论与实践上升到一个新的水平。另一方面，为适应现代畜牧兽医事业的发展，中兽医方剂的应用正在从个体治疗为主转向群体防治，从运用于马、牛等大动物为主转向猪、禽等中小动物，从单纯用于治病转向防治疫病与促进动物生产性能相结合。中药方剂与现代药学结合，探索防治人畜共患疾病的有效途径，确保人类健康，也是重要的内容。