存在于血浆和血细胞中具有相同功能的蛋白质和酶的变异体。蛋白质的变异体称为蛋白质型，酶的变异体称为同工酶或酶型。蛋白质型和酶型不仅在血液中存在，在其他体液如乳汁、唾液、精液及脏器中也存在。蛋白质型受共显性等位基因控制。不同的蛋白质型在以淀粉或聚丙烯酰胺凝胶为介质电泳时，由于泳动速度不同而形成不同的带型。根据带型(表现型)即可判断基因型，并进一步计算基因型频率和基因频率。目前，在猪血液中发现具有多态性的血浆蛋白质有16种和红细胞酶位点有9种。其中最常用于遗传分析的蛋白质有转铁蛋白(Tf)、后转铁蛋白(Ptf)、前白蛋白(Pa)、后白蛋白(Po1、Po2)、血浆铜蓝蛋白(Cp)、血液结合素(Hpx)、淀粉酶(Amy-1、Amy-2)、碱性磷酸酶(Akp)、酯酶(EsⅠ、EsⅡ)等。每一种蛋白质由一个基因座控制，每一基因座又有不同的等位基因，如猪的转铁蛋白已发现有A、B、C、D、E、I 六个不同的等位基因，碱性磷酸酶发现有A、B、C、D、E 五个等位基因，血浆铜蓝蛋白有A、B、C 三个等位基因。猪的蛋白质型已广泛用于探讨家猪的起源和品种、品系间差异以及亲缘关系，可用于标记辅助选择，还可根据蛋白质型或酶型基因频率计算平均基因杂合度，以预测杂种优势。

猪转铁蛋白表现型及基因型