将回归分析与方差分析方法结合起来以一种变量的资料来校正另一种变量的一种统计分析方法。它的特点是能同时分析两个或两个以上的变量。如在进行猪的肥育对比试验时，由于条件限制，各组试验猪的始重有较大差异，试验结束时要分析各组猪增重的差异，就不能再用方差分析法，而应该用协方差分析法，扣除始重不同对增重的影响，以使各组猪增重在相同的基础上比较，从而得出正确的结论。设有两个变量x和y，x叫协变量或伴随变量(如试验时猪的始重)，y为反应变量(猪的增重)，x与y间的协方差用COVxy表示，COVxy＝＝∑(x-)(y-)n-1=， SPxy为x与y间的离均差乘积和。分析的基本步骤有：①提出数据资料的数学模型;②对x、y的平方和及x与y的交叉乘积和以及相应的自由度进行剖分;③进行误差项回归关系的显著性检验，判断 y与x间是否存在线性回归关系，如果不存在回归关系，直接对y变量进行方差分析就行了，如果存在回归关系，应进行下面的继续分析;④计算y的校正值及各处理的校正均数，对校正后的y变量进行F检验;⑤若F检验显著，还需对y变量的各校正均数进行多重比较，以明确各处理校正均数间的差异显著性;⑥必要时，可进一步估计出协方差组分，协方差组分常用于猪数量性状间遗传相关、环境相关等的估计中。