苍蝇的危害主要在于它严重干扰猪只的正常生长，引起应激，造成免疫力低下，影响猪只的生产性能。

苍蝇有微型“细菌弹”之称,携带病菌的本领实在是惊人，光是苍蝇一只脚，可带80-150万个细菌。一只苍蝇包括口器在内的整个肠道，能带上3000万至5亿个细菌。据卫生部门调查，一只苍蝇身上能同时携带 60多种危害人畜疾病的病原体。   

苍蝇是某些疾病细菌、病毒、寄生虫的传播者，研究报告表明苍蝇传播的病原有50多种，其中包括细菌、病毒、寄生虫等多种病原，严重影响养猪业的健康发展。具体情况见（表1）。

蝇幼虫寄生于人、动物活体组织或腔道内引起蝇明症；另外，对工作人员的正常生活也产生很大影响。

表 1  苍蝇传播的疾病

细菌性疾病

布氏杆菌病；产气荚膜梭状芽胞杆菌、埃希氏大肠杆菌；丹毒杆菌；分枝杆菌；巴氏杆菌、沙门氏菌、链球菌、猪脂溢性皮炎等。

病毒性疾病

蓝耳病、伪狂犬病、猪瘟、猪传染性胃肠炎等。

寄生虫

蛔虫病、、等孢子球虫、囊虫病、疥螨虫、等孢球虫等。

其他疾病

乳房炎、附红细胞体病等。