霉菌与毒素的污染会造成经营利益损失，成为畜牧经营成败的关键。因毒素并不是一般药物可有效治疗的，而且饲养过程中有许多必然的应激、环境污染及疾病暴发的问题，这些应激会导致免疫低下的问题，又由于霉菌毒素会伤害免疫系统使免疫低下的问题更加严重进而导致疫苗及药物无效且疾病无法控制的问题普遍存在。故霉菌与毒素的污染对动物健康与饲养效益有绝对的关系，更是畜牧经营成败的关键。目前在中国大陆地区霉菌毒素存在的问题非常严重，各类霉菌毒素的检出严重超出标准的比率达90%以上。
一般认为饲料长霉只会在很差的贮存条件下才产生。但其实在饲料原料生长、收获、加工、运输、贮藏过程皆可能会污染霉菌。而霉菌毒素是霉菌生长的代谢产物，故饲料含有低量霉菌并不表示不含霉菌毒素，因为很多毒素在饲料原料经过蒸煮或打粒等过程后还是稳定的存在，所以霉菌毒素存在的问题是很难避免的。饲料中霉菌的污染除了专业仪器的分析以外我们可简易的由以下的变化得知：包含有饲料谷物粉化及结块、饲料有轻度异味发热、色泽变暗及偶尔畜禽拒食。霉菌的生长除了霉菌毒素的产生还会造成维生素、氨基酸及能量等等饲料中营养的损耗。除了这些对饲料及营养负面的影响以外对猪只健康及产能的影响可见表1：
目前已知道的霉菌毒素种类约有300多种其中对猪只健康及产能危害较大的包含：黄曲毒素(aflatoxin)、赭曲毒素(ochratoxins)、玉米赤霉酰酮(zearalenone,F2)及新月毒素群(T2,呕吐毒素DON)。
毒素对猪只健康产能的影响分述如下：
1霉菌毒素攻击消化道
当霉菌毒素(新月毒素群T2,呕吐毒素DON)进入肠道后会刺激肠道黏膜引起发炎，并启动类似紧迫反应的症状：呕吐毒素于食用后仅40min就会产生下痢或呕吐等现象，于仔猪时期对产能的影响很大，例如一些仔猪出生以后早发型下痢的问题，其诱发的紧迫反应后续导致的生理现象如下：肝功能下降、肾脏负担大、表皮组织受损、对其他毒素耐抗性下降、胃酸分泌增加、表皮细胞受损、呕吐、胃肠免疫保护下降、诱发消化道感染症、霉菌毒素再次攻击消化道(新月毒素群T2,呕吐毒素DON)，仔猪在初期需要营养及母猪的初乳免疫的转移。但在这时期的下痢、吸收不良及厌食对仔猪照成的伤害及后续产能的影响是很大的。
2霉菌毒素攻击肝脏
肝脏内有许多的分解酶，能将汇集肝脏中的霉菌毒素破坏或分解成毒性小或较易排出体外的水溶性物质，达到解毒的目的，但高量的霉菌毒素对肝脏运作是一种负担。且霉菌毒素(黄曲毒素AFL、呕吐毒素DON)主要是攻击肝细胞的线粒体(发电厂)，导致肝细胞静止死亡;脂肪堆积形成脂肪肝;肝硬化导致肝衰竭。当肝功能下降则会引发全面的生理问题：消化酶合成减少、食欲减退、饲料效率差、产能低下、影响血液代谢活力下降、黄疸、内脏出血，血浆蛋白形成减少，导致药效差、组织水肿、乳房水肿，当肝脏解毒功能差时合成分解毒素的酵素也减少，导致对药物的毒性残余物质不容易分解代谢掉因此药物对肝肾的伤害也加剧，进而导致肝中毒、细胞的修补能力下降、疾病愈后差、疫病不断、尿酸合成增加、环境氨气浓度增加。
3攻击肾脏细胞及近曲小管
霉菌毒素(赭曲毒素OTA)会抑制尿酸排出因此导致尿酸盐沉着、肾肿大、肾纤维化及其他毒物无法排出，使毒素毒性增加、药物副作用又再加大。
4霉菌毒素攻击免疫系统
即使摄食入低量的霉菌毒素(新月毒素群T2,呕吐毒素DON,黄曲毒素AFL)也会引起免疫不全及降低对各种传染病的抵抗力。且由于免疫系统遭破坏，疫苗注射的效果也变差。霉菌毒素对免疫系统的破坏主要有以下几个路径：抑制骨髓、脾脏及胸腺的蛋白质生成，抑制B细胞、T-细胞合成，DON还会影响淋巴细胞细胞素生成及造成胸腺萎缩。
5霉菌毒素攻击生殖系统
霉菌毒素对生殖系统影响最大的毒素是玉米赤霉烯酮，因为其结构类似动情素(F2毒素)、其会与组织内雌性素接受器结合引发复合性的繁殖障碍。抑制胚胎发育，导致死胎、初生仔猪死亡、木乃伊胎、外翻腿、流产及畸形，异常发情，乳房水肿、乳汁分泌不足，子宫角扭转，延长离乳与发情间距。
6解决霉菌毒素问题，需要全方位的措施
霉菌毒素有急性毒性及慢性毒性2种，短则40 min以内对消化道及免疫系统造成伤害。要事先防止此种霉菌毒素污染是非常困难的，故近年来不断的尝试许多方法将霉菌毒素无毒化或去除。表2为目前常用的处理霉菌毒素的方式及效果。在霉菌杀灭的部分可使用丙酸及Nystatin皆可有效的达到杀霉的效果。毒素吸附的部分目前市面常用水合硅酸铝、酵母细胞壁及分解酶。水合硅酸铝是开发较早的毒素吸附剂，已有的研究报导较多且完整目前已开发许多衍生性产品。猪场动力网为中国最专业的养猪技术网站。水合硅酸铝其表面结构对霉菌毒素具亲合力，价格便宜，但缺点是对新月毒素群、呕吐毒素及玉米赤霉酰酮的效果差。酵母细胞壁则是藉由酵母细胞壁上的碳水化合物来吸附霉菌毒素，对玉米赤霉酰酮的效果有增加但对新月毒素群及呕吐毒素的吸附效果依然不佳。后续开发使用分解酶将毒素分解，虽然对几种造成猪只危害的霉菌毒素的效果不错，足以弥补传统吸附剂的不足可是酵素作用需要一定的时间，且新月毒素群及呕吐毒素仅40 min即对猪只造成伤害接着造成免疫低下等问题。故目前常使用的这几种霉菌及霉菌毒素处理方式。对猪只的健康及产能的提升是有限的。寻求好的方式来解决霉菌及霉菌毒素的污染问题是必要的。若要有效地解决霉菌及霉菌毒素的问题必需分别针对饲料中霉菌的杀灭、全面吸附、体内已有毒素的排出及修补受损的组织与系统采取全方位的措施，如此才能够快速地恢复猪只健康并提升产能。
